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7、第七章 作始也简 “模型 ...


  •   “模型只是压缩假设的一种方式。如果实验不支持它,就改模型。如果重复实验仍然不支持,就改机制假设。我们不是来证明AI对的。真正的目标,是缩短从疾病机制假设,到实验验证,再到下一轮假设的循环时间。”——《第七章-作始也简》

      一、干湿整合

      二零二五年三月|Z城沈砚之父母家

      晚上七点四十。沈砚之坐在书桌前。电脑屏幕上有一份二十七页的内部预算草案。文件名:ALS Translational Research Initiative(渐冻症转化研究计划)
      沈砚之静静看了几秒,拿起手机拨出一个号码。
      响了两声,接通。
      “你最好告诉我这不是你凌晨三点喝多以后发来的。”麦克斯的声音带着沉重的睡意与沙哑。
      沈砚之看了一眼窗外一片漆黑的城市:“你翻预算表了?”
      “我刚被邮件提示音吵醒,顺手点开。”麦克斯那头顿了顿,“沈。”
      “嗯。”
      “你他妈是认真的?”
      “认真的。”
      电话那头安静了下来,只剩下轻微的呼吸声。几秒后,一阵被子摩擦的杂音传过来。麦克斯显然已经从床上坐了起来。
      “什么性质?”
      “Biotech。”
      “单一管线?买断哪家药企发不出薪水抛售的早期分子?”
      “不是。”沈砚之打开架构图,“平台型。”
      麦克斯没有立刻反驳,只是静静听着。
      “第一层是干实验,做算力与靶点构建。AI分子生成、蛋白质结构与相互作用预测、药物ADME性质模拟,加上ALS患者的多组学数据融合。”
      “第二层呢?”
      “湿实验与验证。患者来源运动神经元模型、全基因组筛选、类器官,后面接自动化高通量合成与筛选。”沈砚之字句清晰,“我们要建立最贴近患者真实病理机制的表型筛选平台。”
      电话里的静默拉得很长。
      “第三层是转化。”沈砚之继续说道,“PK/PD、生物标志物开发、毒理与初步CMC。临床部分先和顶尖的医院做联合研究。”
      他顿了顿:“换句话说,我们握住最核心的前端,包括靶点发现、分子设计、底层数据和病理验证。”
      麦克斯沉默许久,再开口时,语气里多了几分创业搭子的冷静:“这听起来可不简单是一家普通Biotech的商业计划书。”
      “本来就不是。”沈砚之看着屏幕上的架构图,“我想做的是一个干湿整合的基础平台。”
      麦克斯没有立刻回答。

      二、搭档然诺

      二零二五年三月|Z城沈砚之父母家

      麦克斯起身走到窗边,脑子飞速旋转。
      他和沈砚之很少讨论谁是老板。现在公司上市,规矩变多,沟通被冗长的董事会纪要和层层汇报挤压,但他们两人之间的沟通仍保持着最初的直接和高效。
      “你准备动用上市公司的资金?”麦克斯直截了当地问。
      “不,用我自己的个人资产。”沈砚之答道。
      “第一阶段四年的预算,烧掉这个数。”麦克斯语气里的睡意全没了,“这里面还不算后面的三期临床。”
      沈砚之轻声笑了一下:“不到我净资产的一半。”
      “沈,这不是钱的问题!你知道这不是重点。你知道从零开始做药要多久?”麦克斯的声音紧绷,“十年,二十年,甚至更久。这还是在一切顺风顺水的前提下。而你——”麦克斯的声音突然卡在半空。
      窗外街道上有车辆驶过。轮胎压在路面上,发出沉闷的碾压声。
      沈砚之靠回椅背,语气平静:“而我可能等不了那么久。所以,更不能按照常规药企那种节奏来做。”
      麦克斯没有再劝。他太了解沈砚之了。
      麦克斯重新审视起那份预算。
      “你这里为什么留了这么高比例的基础研究经费?”
      “因为关于ALS,我们甚至连该问什么问题都不知道。”
      “所以这笔钱不绑定短期产出指标。”
      “对。”沈砚之补充道,“不能要求发几篇CNS,交出多少个候选分子。一旦绑定这种KPI,研究人员会本能地选择最容易交差的结果,导致无用的重复。”
      麦克斯轻轻呼出一口气,声音里透出一丝怀念:“你还是当年的老样子。”
      沈砚之嘴角微微弯了弯:“你倒是记得清楚。”
      “我当然记得。”麦克斯无奈,“那间破宿舍我睡了四年。你半夜把我叫起来讨论的时候,我就知道这辈子大概是甩不掉你了。”
      沈砚之轻轻活动了一下略显僵硬的右臂:“那你现在可以选择辞职。”
      “滚。”
      两个人同时笑了。笑声很短,在寂静里迅速消散。
      “说吧。”麦克斯的声音恢复了冷静,“你到底需要我做什么。”
      沈砚之看着屏幕上的架构规划:“美东这边,你帮我把上市公司和主营业务稳住。我的个人投资动作,暂时不需要向现有的董事会透露。”
      “投资者那边呢?”
      “同样保密。等平台跑通了再说。”
      麦克斯思考了片刻:“可以,我来处理。但我有条件。”
      “你说。”
      “你可以花钱,可以赌。但团队必须按照Biotech的标准来建。首席科学家、转化医学负责人等等岗位,都必须配备专人。你不能把所有事都扛在自己一个人身上。”
      沈砚之低头看了一眼自己放在桌上的右手,沉默片刻后应道:“好。”
      “还有最重要的一条。”麦克斯的语气极为严肃,“别把这家公司做成你的个人遗嘱。把它做成一家即使将来你不在了,也能靠自己的机制运转、不断推出新药的公司。”
      沈砚之转头看向窗外,许久没有说话。
      最后,他低声道:“好。”
      麦克斯没有再纠结。他们之间,有些承诺只要说出口,就不用多问。
      “对了,”挂电话前,麦克斯忽然问,“公司名字想好了吗?”
      沈砚之划动着屏幕上的电子文件:“还没。”
      “那先别急着取。”
      “为什么?”
      “因为按照你以前的习惯,你一定会取一个像‘Project-01’这样毫无美感的名字。”
      沈砚之笑了一声:“那名字交给你取。”
      “这还差不多。”
      “我不怎么放心。”
      “晚了,我挂了。”
      听筒里传出了忙音。
      书房安静下来。
      沈砚之把手机放在桌上,打开那份预算,又看了一遍最下面那一栏:Long-term unrestricted basic research(长期、无指定成果要求的基础研究经费)。
      他把这部分的预算金额又往上调了一档。

      三、吾有“四宝”

      二零二五年三月|Z城生物医药基地

      二零二五年三月底,沈砚之的新公司在Z城南部的生物医药基地筹备成立。
      初始团队只有十几个人,架构是一支跨学科的攻坚小队。其中,最核心的成员有四人,分别是:算法工程师刘一舟、工艺工程师杜倚衡、制剂工程师丁允成、负责规模化放大的贺肖伟。
      临时办公室不大,门口还没有正式的企业Logo。然而,核心区的自动化实验室已在以惊人的效率昼夜不停地搭建。
      自动化液体处理工作站、高内涵细胞成像与智能培养系统、高速数据采集服务器,以及专门用于单细胞与空间组学分析的高性能计算基础设施,被一箱箱有序地运进园区。沈砚之站在玻璃隔断前,看着那些代表着最前沿算力与精密的仪器被逐一安放就位。
      一天下午,公司内部会议在临时办公室里召开。
      几人围坐在长桌两侧。桌上散落几只印着园区logo的纸杯。一台临时接上的投影仪把光线投射在对面白墙上。窗外,园区的施工声隐约传来。
      沈砚之站在投影旁,声音不高,却压过了窗外的施工声:“我们不以预测一个候选分子的成功概率为终点。真正的目标,是缩短从疾病机制假设,到实验验证,再到下一轮假设的循环时间。”
      他停顿了一秒,目光从屏幕移向在座的人。
      算法工程师刘一舟抬起头,手指还停在打开的笔记本键盘上。“具体怎么做?”他问,语气里带着迫不及待要上手拆解问题的兴奋。
      沈砚之没有立刻回答。他拿起遥控笔,点开第一张图。
      白墙上,一张网络图缓缓展开。
      图的中心是一个深色的节点,标注着简洁的三个字母:ALS。它的周围,密密麻麻地连接着一圈节点,包括RNA代谢、蛋白质稳态、轴突运输、线粒体功能、应激反应、神经炎症、胶质细胞状态、突触功能,以及不同遗传背景。有些连线是实线,粗细不一。有些是虚线,若隐若现。节点的颜色从冷蓝过渡到浅灰,像一张尚未完全显影的地图。
      “先不要把这些东西当成靶点。”沈砚之说,“把它们当成假设。”
      屏幕切换。
      第二张图很简洁。一个循环箭头,从“假设”到“计算预测”,再到“实验问题”,最后回到“模型修正”。
      “我们真正要建立的,是一个可以不断被实验纠正的疾病模型。”沈砚之继续道,“每一个计算预测,都必须能够转化成实验问题。每一个实验结果,都必须能够反过来优化模型。”
      刘一舟一手托腮,眼眨啊眨:“如果模型的每一次修正都依赖于实验结果,那么模型本身就失去了先验的预测价值。这实际上是在建立一个事后拟合系统。”
      制剂工程师丁允成坐得笔直。他面前的笔记本摊开,上面已经用不同颜色的笔标注了密密麻麻的符号:“所以你的意思是,如果模型和实验冲突,我们应该先怀疑实验?”
      刘一舟低低地笑了一声,把椅子往后仰了仰,双手交叠放在脑后,露出一点促狭的神情:“实验结果受特定实验室设备和操作的影响。再说了,你们那领域假数据不要太多哦。当然要防止大模型向这些噪声偏倚了。”
      空气里出现了一瞬间的凝滞。
      坐在丁允成旁边的贺肖伟轻轻叹了口气。他是最常充当“缓冲带”的那个,既需要听懂丁允成近乎偏执的逻辑,也要把刘一舟那些半开玩笑的提议翻译成可执行的方案。
      “一舟,”贺肖伟开口,带着一点无奈的耐心,“沈总的意思大概是,模型要保持开放。规模化的时候,我们也经常遇到同样的问题。实验室数据漂亮,一放大就翻车。这时候优先怀疑的,确实是放大工艺,而不是直接否定原始假设。”
      “我没有说怀疑实验。”刘一舟立刻纠正,“我是说,在排除实验误差之前,不应轻易否定模型的结构合理性。”
      这时,一直沉默的杜倚衡果断开口。
      “行了。”她说,目光先扫过丁允成,再落到刘一舟身上:“我们现在连第一批可重复的实验数据都没有,谈可证伪还太早。”
      她又转向沈砚之:“沈总,你继续。我们听。”
      沈砚之看着这四个宝贝,嘴角几不可察地动了一下。
      他重新点回那张网络图。“如果模型和实验冲突,优先怀疑模型。”沈砚之平静地说,“模型不是答案。模型只是压缩假设的一种方式。如果实验不支持它,就改模型。如果重复实验仍然不支持,就改机制假设。”
      房间里再次安静下来。
      刘一舟摇头晃脑地敲着键盘,把这句话录入笔记。丁允成眉头微皱,显然还在消化逻辑。贺肖伟轻轻点了点头。杜倚衡则靠回椅背,目光平静地看着屏幕,像是在评估这句话在实际工艺落地时会遇到多少阻力。
      沈砚之目光扫过所有人,最后落回那张还亮着的网络图上。“我们不是来证明AI对的。”
note 作者有话说
第7章 第七章 作始也简

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